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疾患ゲノム研究部

概要

　ヒト全ゲノム塩基配列が解読されて以来、網羅的なゲノム疫学、疾患ゲノム解析が可能になってきました。ゲノムは生命の設計図であり、その網羅的な解析を行えば病気などの表現型の全体像を見渡すことができるようになります。また、網羅的なゲノム解析研究は患者さんにご提供いただいたサンプルが原点であるため、解析の成果を直接、臨床の現場に還元できる可能性が大きいことや、研究の仮設を立てずに解析を進めるため、これまでには考えもしなかった疾患関連遺伝子やタンパク質を同定することが可能になり、疾患バイオマーカーや個々人に適した医療といった革新的な診断法や治療法の開発、すなわちプレシジョン・メディシンに繋がります。近年、このような網羅的ゲノム解析は、遺伝的多様性、遺伝子発現量の多様性といった、DNAやRNAの質的、量的な違いを知ることにより可能であることが明らかとなってきています。疾患ゲノム研究部では、主にNCGGバイオバンクで収集された検体について多様性からのアプローチを全ゲノム関連解析や次世代シークエンサー等を用いたゲノム解析手法および機械学習や人工知能を用いた情報科学等の高度な技術を駆使して推進します。また、家族性の認知症の一部には原因の遺伝子変異がわかっている症例もあり、遺伝子配列解析（クリニカルシーケンス）をすることで遺伝子診断にも貢献しています。このような解析を通じて老年病に関連した分子やそのネットワークの同定と解析を通したエビデンスに基づく予知予防法の開発や創薬シーズの探索につながる研究を積極的に進めています。

研究テーマ

  • 網羅的ゲノム解析による老年病関連遺伝子の同定と解析

  • 全ゲノム、エクソーム配列解析による老年病原因、関連遺伝子の同定と解析

  • 全RNA配列解析とゲノム解析を統合した機能的疾患バリアントの同定と解析

  • ゲノム、オミクスデータを活用したドラッグリポジショニング

  • 全ゲノム関連解析データを活用したポリジェニックリスクスコアの構築と活用

  • 大規模ゲノム臨床情報統合データベースの構築と公開

  • 大規模解析情報の機械学習や人工知能を用いた疾患発症予知法の開発および創薬関連シーズの探索

  • 最新ゲノム、オミックス解析手法や情報解析法等の技術導入・開発

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メンバー

部長

　尾崎 浩一（Kouichi Ozaki）

　E-mail: ozakikk(at)ncgg.go.jp

研究員

　浅海 裕也 (Yuya Asanomi)

　光森 理紗（Risa Mitsumori）

研究補助員

　鈴木 三惠（Mie Suzuki）

　笹岡 文（Fumi Sasaoka）

　錦 匠（Takumi Nishiki）

　生田 啓子（Keiko Ikuta）

　鈴木 枝里子（Eriko Suzuki）

　山根 美奈（Mina Yamane）

　深谷 未奈（Mina Fukaya）

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原著論文（2019年以降、「*」 は責任著者）

  1. Cross-ancestry genome-wide analysis of atrial fibrillation provides new insights into disease biology and enables polygenic prediction of cardioembolic risk. Miyazawa K, Ito K, Ito M, Zou Z, Kubota M, Nomura S, Matsunaga H, Koyama S, Ieki H, Akiyama M, Kurosawa R, Yoshida H, Ozaki K et al. Nature Genetics 55(2): 187-197 (2023).
    doi:10.1038/s41588-022-01284-9このリンクは別ウィンドウで開きます
  2. Early-onset Alzheimer’s disease associated with neuromyelitis optica spectrum disorder. Fujisawa C, Saji N, Takeda A, Kato T, Nakamura A, Sakurai K, Asanomi Y, Ozaki K et al. Alzheimer Disease & Associated Disorders 37(1): 85-87 (2023).
    doi:10.1097/WAD.0000000000000517このリンクは別ウィンドウで開きます
  3. Deep learning-based age estimation from chest X-rays indicates cardiovascular prognosis. Ieki H, Ito K, Saji M, Kawakami R, Nagatomo Y, Takada K, Kariyasu T, Machida H, Koyama S, Yoshida H, Kurosawa R, Matsunaga H, Miyazawa K, Ozaki K et al. Communications Medicine 2(1): 159 (2022).
    doi:10.1038/s43856-022-00220-6このリンクは別ウィンドウで開きます
  4. Identification of potential blood biomarkers for early diagnosis of Alzheimer’s disease through immune landscape analysis. Shigemizu D, Akiyama S, Mitsumori R. Niida S, Ozaki K*. NPJ Aging 8: 15 (2022).
    doi:10.1038/s41514-022-00096-9このリンクは別ウィンドウで開きます
  5. Whole-genome sequencing reveals novel ethnicity-specific mutations in MFSD3 and MRPL43 associated with dementia with Lewy bodies. Shigemizu D, Asanomi Y, Akiyama S, Higaki S, Sakurai T, Niida S, Ozaki K. American Journal of Medical Genetics Part B: Neuropsychiatric Genetics 189(5): 139-150 (2022).
    doi:10.1002/ajmg.b.32908このリンクは別ウィンドウで開きます
  6. Whole-genome sequencing reveals novel ethnicity-specific rare variants associated with Alzheimer’s disease. Shigemizu D, Asanomi Y, Akiyama S, Mitsumori R, Niida S, Ozaki K*. Molecular Psychiatry 27: 2554-2562 (2022).
    doi:10.1038/s41380-022-01483-0このリンクは別ウィンドウで開きます
  7. A functional variant SHARPIN confers increased risk of Alzheimer’s disease. Asanomi Y, Shigemizu D, Akiyama A, Mitsumori R, Miyashita A, Hara N, Ikeuchi T, Niida S, Ozaki K*.  Journal of Human Genetics 67: 203-208 (2022).
    doi:10.1038/s10038-021-00987-xこのリンクは別ウィンドウで開きます
  8. JAMIR-eQTL: Japanese genome–wide identification of microRNA expression quantitative trait loci across dementia types. Akiyama S, Higaki S, Ochiya T, Ozaki K, Niida S, Shigemizu D. Database 2021: baab072 (2021).
    doi:10.1093/database/baab072このリンクは別ウィンドウで開きます
  9. Dementia subtype prediction models constructed by penalized regression methods for multiclass classification using serum microRNA expression data. Asanomi Y, Shigemizu D, Akiyama S, Sakurai T, Ozaki K, Ochiya T, Niida S. Scientific Reports 11: 20947 (2021).
    doi:10.1038/s41598-021-00424-1このリンクは別ウィンドウで開きます
  10. Structural and numerical Y chromosomal variations in elderly men identified through multiplex ligation-dependent probe amplification. Ogiwara Y, Miyado M, Suzuki E, Niida S, Ozaki K. Fukami M. Journal of Human Genetics 66: 1181-1184 (2021).
    doi:10.1038/s10038-021-00943-9このリンクは別ウィンドウで開きます
  11. Ethnic and trans-ethnic genome-wide association studies identify new loci influencing Japanese Alzheimer’s disease risk. Shigemizu D, Mitsumori R, Akiyama S, Miyashita A, Morizono T, Higaki S, Asanomi Y, Hara N, Tamiya G, Kinoshita K, Ikeuchi T, Niida S, Ozaki K*. Translational Psychiatry 11: 151 (2021).
    doi:10.1038/s41398-021-01272-3このリンクは別ウィンドウで開きます
  12. Association of an IGHV3-66 gene variant with Kawasaki disease. Johnson T, Mashimo Y, Wu JY, Yoon D, Hata A, Kubo M, Takahashi A, Tsunoda T, Ozaki K et al. Journal of Human Genetics 66: 475-489 (2021).
    doi:10.1038/s10038-020-00864-zこのリンクは別ウィンドウで開きます
  13. Prognosis prediction model for conversion from mild cognitive impairment to Alzheimer’s disease created by integrative analysis of multi-omics data. Shigemizu D. Akiyama S, Higaki S, Sugimoto T, Sakurai T, Boroevich KA, Sharma A, Tsunoda T, Ochiya T, Niida S, Ozaki K. Alzheimer's Research & Therapy 12: 145 (2020).
    doi:10.1186/s13195-020-00716-0このリンクは別ウィンドウで開きます
  14. Population-specific and trans-ancestry genome-wide analyses identify distinct and shared genetic risk loci for coronary artery disease. Koyama S, Ito K, Terao C, Akiyama M, Horikoshi M, Momozawa Y, Matsunaga H, Ieki H, Ozaki K et al. Nature Genetics 52: 1169-1177 (2020).
    doi:10.1038/s41588-020-0705-3このリンクは別ウィンドウで開きます
  15. Lower DNA methylation levels in CpG island shores of CR1, CLU, and PICALM in the blood of Japanese Alzheimer’s disease patients. Mitsumori R, Sakaguchi K, Shigemizu D, Mori T, Akiyama S, Ozaki K, Niida S, Shimoda N. PLoS ONE 15(9): e0239196 (2020).
    doi:10.1371/journal.pone.0239196このリンクは別ウィンドウで開きます
  16. Identification of potential blood biomarkers for early diagnosis of Alzheimer’s disease through RNA-sequencing analysis. Shigemizu D, Mori T, Akiyama S, Higaki S, Watanabe H, Sakurai T, Niida S, Ozaki K. Alzheimer's Research and Therapy 12: 87 (2020).
    doi:10.1186/s13195-020-00654-xこのリンクは別ウィンドウで開きます
  17. Large-scale genome-wide association study in a Japanese population identifies novel susceptibility loci across different diseases. Ishigaki K, Akiyama M, Kanai M, Takahashi A, Kawakami E, Sugishita H, Sakaue S, Matoba N, Low SK, Okada Y, Terao C, Amariuta T, Gazal S, Kochi Y, Horikoshi M, Suzuki K, Ito K, Koyama S, Ozaki K et al. Nature Genetics 52(7): 669-679 (2020).
    doi:10.1038/s41588-020-0640-3このリンクは別ウィンドウで開きます
  18. Transethnic meta-analysis of genome-wide association studies identifies three new loci for coronary artery disease. Matsunaga H, Ito K, Akiyama M, Takahashi A, Nomura S, Ozaki K et al. Circulation: Genomic and Precision Medicine 13(3): e002670 (2020).
    doi:10.1161/CIRCGEN.119.002670このリンクは別ウィンドウで開きます
  19. A comparison of machine learning classifiers for dementia with Lewy bodies using miRNA expression data. Shigemizu D, Akiyama S, Asanomi Y, Boroevich KA, Sharma A, Tsunoda T, Sakurai T, Ozaki K, Ochiya T, Niida S. BMC Medical Genomics 12: 150 (2019).
    doi:10.1186/s12920-019-0607-3このリンクは別ウィンドウで開きます
  20. Pathway analysis with genome-wide association study (GWAS) data detected the association of atrial fibrillation with the mTOR signaling pathway. Ebana Y, Sun Y, Yang X, Watanabe T, Makita S, Ozaki K, Tanaka T, Arai H, Furukawa T. International Journal of Cardiology. Heart & Vasculature 24: 100383 (2019).
    doi:10.1016/j.ijcha.2019.100383このリンクは別ウィンドウで開きます
  21. A rare functional variant of SHARPIN attenuates the inflammatory response and associates with increased risk of late-onset Alzheimer's disease. Asanomi Y, Shigemizu D, Miyashita A, Mitsumori R, Mori T, Hara K, Ito K, Niida S, Ikeuchi T, Ozaki K*. Molecular Medicine 25: 20 (2019).
    doi:10.1186/s10020-019-0090-5このリンクは別ウィンドウで開きます
  22. Risk prediction models for dementia constructed by supervised principal component analysis using miRNA expression data. Shigemizu D, Akiyama S, Asanomi Y, Boroevich KA, Sharma A, Tsunoda T, Matsukuma K, Ichikawa M, Takizawa S, Sakurai T, Ozaki K, Ochiya T, Niida S. Communication Biology 2: 77 (2019).
    doi:10.1038/s42003-019-0324-7このリンクは別ウィンドウで開きます

2018年以前の主要論文、「*」は責任著者、「†」は第一著者と同等

  1. Comparative analysis of cerebrospinal fluid metabolites in Alzheimer’s disease and idiopathic normal pressure hydrocephalus in a Japanese cohort. Nagata Y, Hirayama A, Ikeda S, Shirahata A, Shoji F, Maruyama M, Kayano M, Bundo M, Hattori K, Yoshida S, Goto Y, Urakami K, Soga T, Ozaki K, Niida S. Biomarker Research 6: 5 (2018).
    doi:10.1186/s40364-018-0119-xこのリンクは別ウィンドウで開きます
  2. Identification of six novel genetic loci associated with atrial fibrillation in Japanese population. Low SK, Takahashi A, Ebana Y, Ozaki K et al. Nature Genetics 49: 953-958 (2017).
    doi:10.1038/ng.3842このリンクは別ウィンドウで開きます
  3. A functional SNP in FLT1 increases risk of coronary artery disease in a Japanese population. Konta A, Ozaki K* et al. Journal of Human Genetics 61(5): 435-441 (2016).
    doi:10.1038/jhg.2015.171このリンクは別ウィンドウで開きます
  4. Molecular genetics of coronary artery diseases. Ozaki K*, Tanaka T. Journal of Human Genetics 61: 71-77 (2016).
    doi:10.1038/jhg.2015.70このリンクは別ウィンドウで開きます
  5. Genome-wide association study of peripheral arterial disease in a Japanese population. Matsukura M, Ozaki K et al. PLoS ONE 10(10): e0139262 (2015).
    doi:10.1371/journal.pone.0139262このリンクは別ウィンドウで開きます
  6. Integrating genetic, transcriptional, and functional analyses to identify five novel genes for atrial fibrillation. Sinner MF, Tucker NR, Lunetta KL, Ozaki K† et al. Circulation 130: 1225-1235 (2014).
    doi:10.1161/circulationaha.114.009892このリンクは別ウィンドウで開きます
  7. Meta-analysis identifies six new susceptibility loci for atrial fibrillation. Ellinor PT, Lunetta KL, Albert CM, Glazer NL, Ritchie MD, Smith AV, Arking DE, Müller-Nurasyid M, Krijthe BP, Lubitz SA, Bis JC, Chung MK, Ozaki K† et al. Nature Genetics 44: 670-675 (2012).
    doi:10.1038/ng.2261このリンクは別ウィンドウで開きます
  8. Novel genetic markers associate with atrial fibrillation risk in Europeans and Japanese. Lubitz SA, Lunetta KL, Lin H, Arking DE, Trompet S, Li G, Krijthe BP, Chasman DI, Barnard J, Kleber ME, Dörr M, Ozaki K† et al. Journal of the American College of Cardiology 63(12): 1200-1211 (2014).
    doi:10.1016/j.jacc.2013.12.015このリンクは別ウィンドウで開きます
  9. Genome-wide association study identified four novel susceptibility loci for Kawasaki disease. Onouchi Y, Ozaki K et al. Nature Genetics 44: 517-521 (2012).
    doi:10.1038/ng.2220このリンクは別ウィンドウで開きます
  10. Common variants in CASP3 confer susceptibility to Kawasaki disease. Onouchi Y, Ozaki K et al. Human Molecular Genetics 19(14): 2898-2906 (2010).
    doi:10.1093/hmg/ddq176このリンクは別ウィンドウで開きます
  11. SNPs in BRAP associated with risk of myocardial infarction in Asian populations. Ozaki K et al. Nature Genetics 41: 329-333 (2009).
    doi:10.1038/ng.326このリンクは別ウィンドウで開きます
  12. A functional SNP in PSMA6 confers risk of myocardial infarction in the Japanese population. Ozaki K et al. Nature Genetics 38: 921-925 (2006).
    doi:10.1038/ng1846このリンクは別ウィンドウで開きます
  13. Functional variation in LGALS2 confers risk of myocardial infarction and regulates lymphotoxin-α secretion in vitro. Ozaki K et al. Nature 429: 72-75 (2004).
    doi:10.1038/nature02502このリンクは別ウィンドウで開きます
  14. Functional SNPs in the lymphotoxin-α gene that are associated with susceptibility to myocardial infarction. Ozaki K et al. Nature Genetics 32: 650-654 (2002).
    doi:10.1038/ng1047このリンクは別ウィンドウで開きます

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主な講演、シンポジウム等（2019年以降）

  1. 尾崎浩一 「老年病におけるゲノム医科学の現状と近未来」
    広島大学大学院医系科学研究科　循環器内科学リサーチセミナー
    2022年8月8日　WEB開催
  2. 尾崎浩一 「ゲノム医科学概論」
    広島大学大学院医系科学研究科　3年次講義
    2022年5月18日　WEB開催
  3. 尾崎浩一 「Large-scale genomic analysis for Alzheimer’s disease in Japanese」
    第40回日本認知症学会学術集会　シンポジウム16
    2021年11月28日　東京
  4. 尾崎浩一 「日本人における認知症のゲノム解析」
    日本人類遺伝学会第66回大会　シンポジウム1　生活習慣病のゲノム研究の最前線
    2021年10月14日　横浜
  5. 尾崎浩一 「ゲノム医科学概論」
    広島大学大学院医系科学研究科　3年次講義
    2021年6月7日　WEB開催
  6. Ozaki K. "Molecular genetics of cognitive impairment in Japanese"
    Asian Forum of Alzheimer’s Disease (AFAD) 2019
    2020年2月8日　Tokyo
  7. 尾崎浩一 「NCGGにおける認知症のゲノム解析」
    東京都健康長寿医療センター　教育セミナー
    2020年1月14日　東京
  8. Ozaki K. "Molecular Genetics of Late-onset Alzheimer’s disease"
    The 5th NCGG – ICAH Symposium
    2019年4月11日　Obu

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新聞、メディア等

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